Article (Périodiques scientifiques)
First draft genome sequence of a strain belonging to the Zoogloea genus and its gene expression in situ
MULLER, Emilie; NARAYANASAMY, Shaman; Zeimes, Myriam et al.
2017In Standards in Genomic Sciences, 12 (64)
Peer reviewed vérifié par ORBi
 

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Détails



Mots-clés :
genome; metgenomics; metatranscriptomics; sequencing; biofuel; bioplastics
Résumé :
[en] The Gram-negative beta-proteobacterium Zoogloea sp. LCSB751 (LMG 29444) was newly isolated from foaming activated sludge of a municipal wastewater treatment plant. Here, we describe its draft genome sequence and annotation together with a general physiological and genomic analysis, as the first sequenced representative of the Zoogloea genus. Moreover, Zoogloea sp. gene expression in its environment is described using metatranscriptomic data obtained from the same treatment plant. The presented genomic and transcriptomic information demonstrate a pronounced capacity of this genus to synthesize poly-β-hydroxyalkanoate within wastewater.
Centre de recherche :
- Luxembourg Centre for Systems Biomedicine (LCSB): Eco-Systems Biology (Wilmes Group)
Disciplines :
Biotechnologie
Auteur, co-auteur :
MULLER, Emilie  ;  University of Luxembourg > Luxembourg Centre for Systems Biomedicine (LCSB)
NARAYANASAMY, Shaman  ;  University of Luxembourg > Luxembourg Centre for Systems Biomedicine (LCSB)
Zeimes, Myriam
LACZNY, Cedric Christian  ;  University of Luxembourg > Luxembourg Centre for Systems Biomedicine (LCSB)
LEBRUN, Laura ;  University of Luxembourg > Luxembourg Centre for Systems Biomedicine (LCSB)
HEROLD, Malte ;  University of Luxembourg > Luxembourg Centre for Systems Biomedicine (LCSB)
Hicks, Nathan D.
Gillice, John D.
Schupp, James M.
Keim, Paul
WILMES, Paul ;  University of Luxembourg > Luxembourg Centre for Systems Biomedicine (LCSB)
 Ces auteurs ont contribué de façon équivalente à la publication.
Co-auteurs externes :
yes
Langue du document :
Anglais
Titre :
First draft genome sequence of a strain belonging to the Zoogloea genus and its gene expression in situ
Date de publication/diffusion :
18 octobre 2017
Titre du périodique :
Standards in Genomic Sciences
ISSN :
1944-3277
Maison d'édition :
BioMed Central, London, Royaume-Uni
Volume/Tome :
12
Fascicule/Saison :
64
Peer reviewed :
Peer reviewed vérifié par ORBi
Focus Area :
Systems Biomedicine
Projet FnR :
FNR3951311 - Systems Biology Of Natural Microbial Assemblages, 2009 (01/02/2010-31/01/2015) - Paul Wilmes
Organisme subsidiant :
FNR - Fonds National de la Recherche
Disponible sur ORBilu :
depuis le 14 novembre 2017

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