References of "1994"
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See detailBiergmann a Biergbau, eng Welt fir sech
Scuto, Denis UL

Article for general public (1994)

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See detailS.A.S. : un exemple à suivre ?
Corbisier, Isabelle UL; Nicaise, Pierre

in Le droit des affaires = Het ondernemingsrecht (1994), (33), 43-80

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See detailÄrger und sportliche Leistung
Steffgen, Georges UL

Scientific Conference (1994, September)

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See detailDer Einfluss der Motivation auf das Persongedächtnis
Krolak-Schwerdt, Sabine UL

Scientific Conference (1994, September)

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See detailMusikalische Formeln als Geimeinplätze in Volksliedern
Sagrillo, Damien UL

Scientific Conference (1994, September)

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See detailCharacterization of some aggregation functions arising from MCDM problems
Fodor, Janos; Marichal, Jean-Luc UL; Roubens, Marc

in Bouchon-Meunier, Bernadette; Yager, Ronald R.; Zadeh, Lotfi A. (Eds.) Proc. 5th Int. Conf. on Information Processing and Management of Uncertainty in Knowledge-Based Systems (IPMU'94) (1994, July)

This paper deals with some characterizations of two classes of non-conventional aggregation operators. The first class consists of the weighted averaging operators (OWA) introduced by Yager while the ... [more ▼]

This paper deals with some characterizations of two classes of non-conventional aggregation operators. The first class consists of the weighted averaging operators (OWA) introduced by Yager while the second class corresponds to the weighted maximum and related operators defined by Dubois and Prade. These characterizations are established via solutions of some functional equations. [less ▲]

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See detailThéorie de Kosslyn et traitement de l'information spatiale
Houssemand, Claude UL

Presentation (1994, April)

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See detailWas kann die Sportpsychologie dem Luxemburger Sport bieten?
Steffgen, Georges UL

Article for general public (1994)

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See detailEducation as Practical Intersubjectivity. Towards a critical-pragmatic understanding of education.
Biesta, Gert UL

in Educational Theory (1994), 44(3), 299-317

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See detailThe Politics of Human Science
Miedema, S.; Biesta, Gert UL; Boog, B. et al

Book published by VUBPress (1994)

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See detailDetection of atmospheric pressure loading using Very Long Baseline Interferometry measurements
van Dam, Tonie UL; Herring, T. A.

in Journal of Geophysical Research (1994), 99(B3), 4505-4518

Loading of the Earth by the temporal redistribution of global atmospheric mass is likely to displace the positions of geodetic monuments by tens of millimeters both vertically and horizontally. Estimates ... [more ▼]

Loading of the Earth by the temporal redistribution of global atmospheric mass is likely to displace the positions of geodetic monuments by tens of millimeters both vertically and horizontally. Estimates of these displacements are determined by convolving National Meteorological Center (NMC) global values of atmospheric surface pressure with Farrell's elastic Green's functions. An analysis of the distances between radio telescopes determined by very long baseline interferometry (VLBI) between 1984 and 1992 reveals that in many of the cases studied there is a significant contribution to baseline length change due to atmospheric pressure loading. Our analysis covers intersite distances of between 1000 and 10,000 km and is restricted to those baselines measured more than 100 times. Accounting for the load effects (after first removing a best fit slope) reduces the weighted root-mean-square (WRMS) scatter of the baseline length residuals on 11 of the 22 baselines investigated. The slight degradation observed in the WRMS scatter on the remaining baselines is largely consistent with the expected statistical fluctuations when a small correction is applied to a data set having a much larger random noise. The results from all baselines are consistent with ∼60% of the computed pressure contribution being present in the VLBI length determinations. Site dependent coefficients determined by fitting local pressure to the theoretical radial displacement are found to reproduce the deformation caused by the regional pressure to within 25% for most inland sites. The coefficients are less reliable at near coastal and island stations. [less ▲]

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See detailSequenz und Sequenz-Struktur Vergleiche und deren Anwendung für die Struktur- und Funktionsvorhersage von Proteinen
Schneider, Reinhard UL

Doctoral thesis (1994)

Zusammenfassung der Inaugural-Dissertation Name: Reinhard Schneider Titel: Sequenz und Sequenz-Struktur Vergleiche und deren Anwendung für die Struktur- und Funktionsvorhersage von Proteinen Betreuer ... [more ▼]

Zusammenfassung der Inaugural-Dissertation Name: Reinhard Schneider Titel: Sequenz und Sequenz-Struktur Vergleiche und deren Anwendung für die Struktur- und Funktionsvorhersage von Proteinen Betreuer: Prof. Dr. K. C. Holmes (MPI für medizinische Forschung, Heidelberg) Durch die sogenannten Genomprojekte wird es in den nächsten Jahren zu einer enormen Vergrößerung der biologischen Sequenzdatenbanken kommen. Eine unabdingbare Voraussetzung zur Nutzung dieses Rohmaterials stellt dabei die Analyse dieser Sequenzdaten mit Hilfe rechnergestützter Methoden dar. Eines der Hauptanwendungsgebiete von Rechnern für die Funktions- und Strukturvorhersage von Proteinen werden dabei selektive Datenbanksuche nach biologisch signifikanten Ähnlichkeiten sein. Zur Signifikanzabschätzung eines Proteinsequenzvergleiches (Alignment) wurde ein empirisch abgeleiteter Homologieschwellenwert definiert. Wichtigstes Merkmal ist dabei eine starke Abhängigkeit von der Länge des betreffenden Alignments. Diese Signifikanzabschätzung ermöglicht sowohl den Ausschluß von nicht verwandten Proteinen, wie auch die Detektion von schwachen Sequenzverwandtschaften. Aufgrund der Allgemeingültigkeit des Homologieschwellenwertes kann er als einfacher und effizienter zusätzlicher Filter für andere Methoden, wie z.B. schnelle Datenbanksuchen, verwendet werden. Es wurde ein neuer Algorithmus für den multiplen Sequenzvergleich entwickelt, der eine relativ geringe rechnerische Komplexität besitzt. Das Hauptmerkmal dieses Algorithmus besteht in der Ableitung von sogenannten positionsabhängigen Konservierungsgewichten, die als zusätzliche Parameter im dynamischen Programmieralgorithmus verwendet werden und zu einer deutlich gesteigerten Sensitivität bei Datenbanksuchen führt. Die programmiertechnische Auslegung des Algorithmus erlaubt die zukünftige Erweiterung auf den Vergleich einer Sequenz gegen ein Sequenzprofil bzw. den Vergleich zweier Sequenzprofile. Um auch zukünftig sensitive Datenbanksuchen in einer vertretbaren Rechenzeit durchführen zu können,, wurde das Programm auf parallele Rechner portiert. Die Ergebnisse zeigen, daß mit den heute verfügbaren massiv parallelen Rechnern ein beinahe interaktives Arbeiten möglich ist. Aufbauend auf dieser Arbeit wird derzeit im Rahmen eines europäischen Projektes die Implementierung der Profilmethoden auf Parallelrechner der neuesten Generation durchgeführt und der Nutzen für das industrielle “Protein design” bestimmt. Mit Hilfe des Homologieschwellenwertes konnte eine Datenbank für homologie-abgeleitete Proteinstrukturen (HSSP) entwickelt werden. Diese Datenbank wird der Öffentlichkeit auf verschiedenen Wegen zugänglich gemacht und hat sich als ein gewisser Standard etabliert. Die Datenbank findet dabei Verwendung im automatisierten dreidimensionalen Modellbau von Proteinstrukturen, sowie als Hilfsmittel und Datengrundlage für ein weitgestecktes Feld von statistischen und anderen theoretischen Arbeiten. Die Verwendung der Datenbank hat einen entscheidenden Beitrag bei der Entwicklung des derzeit besten Programms zur Vorhersage der Sekundärstruktur von Proteinen geleistet. Diese Vorhersagemethode basiert auf einem neuronalen Netzwerk, das die Informationen eines multiplen Sequenzvergleichs ausnutzt. Zur Berechnung der multiplen Sequenzalignments und der dazu notwendigen Datenbanksuche wird das in dieser Arbeit entwickelte Programm verwendet. Die Methode wurde in Form eines Vorhersagedienstes, der über internationale Datenleitungen verfügbar ist, der Öffentlichkeit zugänglich gemacht. Einen neuen Ansatz für die Vorhersage von Proteinstruktur bei fehlender Sequenzverwandtschaft zu einer bereits bekannten Struktur stellt die Methode für das Sequenz-Strukturalignment (“threading”) dar. Dazu wird eine dreidimensionale Struktur in Form von interatomaren Kontakten beschrieben und mit Hilfe von Präferenzparametern die Tauglichkeit einer Sequenz in eine Struktur bewertet. Die Ergebnisse zeigen, daß sowohl eine Verbesserung der abstrahierten Beschreibung für eine dreidimensionale Proteinstruktur, wie auch ein verbesserter Alignmentalgorithmus notwendig ist. Ein in der Praxis vielversprechender Ansatz ist die Verwendung von Methoden, die einerseits eine abstrahierte 3D-Beschreibung zulassen und zusätzlich einen gewissen Grad an Sequenzinformation, etwa in Form eines Sequenzprofils mit einbeziehen. Am Beispiel eines kompletten Chromosoms aus Hefe wurde eine komplexe funktionelle Genomanalyse durchgeführt. Hierbei konnten eine Reihe von biologisch interessanten Sequenzverwandtschaften aufgedeckt werden, waren jedoch mit einem hohen Arbeitsaufwand verbunden. Dabei stellte sich die ungenügende Integration der vorhanden Methoden und heterogenen Datenbanken als Hauptproblem heraus. Die dabei gesammelten Erfahrungen fließen derzeit in die Entwicklung eines integrierten Softwarepackets ein, mit dessen Hilfe es möglich sein wird, den Arbeitsaufwand, der zur Analyse von großen Datenmengen notwendig ist, drastisch zu reduzieren. [less ▲]

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See detailMouse genetics and the development of vertebral column development
Balling, Rudi UL; Koseki, H; Wallin, J et al

in Proceedings Greenwood Genetics Center (1994), (13), 58-60

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Peer Reviewed
See detail[Transgenic mice--biological fundamentals, practices and applications].
Balling, Rudi UL

in DTW. Deutsche tierarztliche Wochenschrift (1994), 101(3), 94-5

The transfer of genes into the germline of mice has become a standard technique of modern biomedical research. In addition to direct microinjection of DNA into the pronuclei of fertilized mouse eggs ... [more ▼]

The transfer of genes into the germline of mice has become a standard technique of modern biomedical research. In addition to direct microinjection of DNA into the pronuclei of fertilized mouse eggs, genes can now also be inactivated via homologous recombination in embryonic stem cells (gene targeting). In the future it will be possible to inactivate any cloned gene via homologous recombination in ES-cells and establish corresponding mouse mutants. [less ▲]

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See detailThe role of Pax-1 in axial skeleton development.
Wallin, J.; Wilting, J.; Koseki, H. et al

in Development (Cambridge, England) (1994), 120(5), 1109-21

Previous studies have identified a single amino-acid substitution in the transcriptional regulator Pax-1 as the cause of the mouse skeletal mutant undulated (un). To evaluate the role of Pax-1 in the ... [more ▼]

Previous studies have identified a single amino-acid substitution in the transcriptional regulator Pax-1 as the cause of the mouse skeletal mutant undulated (un). To evaluate the role of Pax-1 in the formation of the axial skeleton we have studied Pax-1 protein expression in early sclerotome cells and during subsequent embryonic development, and we have characterized the phenotype of three different Pax-1 mouse mutants, un, undulated-extensive (unex) and Undulated short-tail (Uns). In the Uns mutation the whole Pax-1 locus is deleted, resulting in the complete absence of Pax-1 protein in these mice. The other two genotypes are interpreted as hypomorphs. We conclude that Pax-1 is necessary for normal vertebral column formation along the entire axis, although the severity of the phenotype is strongest in the lumbar region and the tail. Pax-1-deficient mice lack vertebral bodies and intervertebral discs. The proximal part of the ribs and the rib homologues are also missing or severely malformed, whereas neural arches are nearly normal. Pax-1 is thus required for the development of the ventral parts of vertebrae. Embryonic analyses reveal that although sclerotomes are formed in mutant embryos, abnormalities can be detected from day 10.5 p.c. onwards. The phenotypic analyses also suggest that the notochord still influences vertebral body formation some days after the sclerotomes are formed. Furthermore, the notochord diameter is larger in mutant embryos from day 12 p.c., due to increased cell proliferation. In the strongly affected genotypes the notochord persists as a rod-like structure and the nucleus pulposus is never properly formed. Since the notochord is Pax-1-negative these findings suggest a bidirectional interaction between notochord and paraxial mesoderm. The availability of these Pax-1 mutant alleles permitted us to define an early role for Pax-1 in sclerotome patterning as well as a late role in intervertebral disc development. Our observations suggest that Pax-1 function is required for essential steps in ventral sclerotome differentiation, i.e. for the transition from the mesenchymal stage to the onset of chondrogenesis. [less ▲]

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Peer Reviewed
See detailPHD - AN AUTOMATIC MAIL SERVER FOR PROTEIN SECONDARY STRUCTURE PREDICTION
ROST, B.; SANDER, C.; Schneider, Reinhard UL

in Computer Applications in the Biosciences [=CABIOS] (1994), 10(1), 53-60

By the middle of 1993, > 30000 protein sequences had been listed. For 1000 of these, the three-dimensional (tertiary) structure has been experimentally solved. Another 7000 can be modelled by homology ... [more ▼]

By the middle of 1993, > 30000 protein sequences had been listed. For 1000 of these, the three-dimensional (tertiary) structure has been experimentally solved. Another 7000 can be modelled by homology. For the remaining 21000 sequences, secondary structure prediction provides a rough estimate of structural features. Predictions in three states range between 35% (random) and 88% (homology modelling) overall accuracy. Using information about evolutionary conservation as contained in multiple sequence alignments, the secondary structure of 4700 protein sequences was predicted by the automatic e-mail sewer PHD, For proteins with at least one known homologue, the method has an expected overall three-state accuracy of 71.4% for proteins with at least one known homologue (evaluated on 126 unique protein chains). [less ▲]

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Peer Reviewed
See detailDossier Dewey. Het ontwerp van een transactionele handelingspsychologie.
Biesta, Gert UL

in Psychologie & maatschappij (1994), 18(2), 123-140

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Peer Reviewed
See detailREDEFINING THE GOALS OF PROTEIN SECONDARY STRUCTURE PREDICTION
ROST, B.; SANDER, C.; Schneider, Reinhard UL

in Journal of Molecular Biology (1994), 235(1), 13-26

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